龙眼菩提子和凤眼菩提子在外表的诸多特征上（外观、大小、质感、密度等）均很相似，最大的区别在于龙眼菩提子每一粒珠体上并没有“凤目”形状的芽眼，取而代之的是一种形式三角状的芽眼。因其三角的形状类似与龙的眼睛，故被称为龙眼菩提子。
有人认为龙眼菩提子和凤眼菩提子是两种相同的果核，其实不然，龙眼菩提子分为“山地”龙眼菩提子和“木瓜”龙眼菩提子两种：“山地”龙眼菩提子主要产自印度，其表面除了芽眼与凤眼菩提子不同外，“山地”龙眼菩提子的表面还比凤眼菩提子多了许多类似虫眼的小洞；而“木瓜”龙眼菩提子则属于凤眼菩提子的一个变种，与凤眼菩提子的区别就在于芽眼的不同，“木瓜”龙眼菩提子主要产自尼泊尔，表面纹理质感和凤眼菩提子十分接近。
“山地”龙眼菩提子和“木瓜”龙眼菩提子并没有优劣之分，我们在挑选和购买时首先关注的应是籽身的皮壳。未经把玩的龙眼菩提子皮壳呈现黄褐色，且颜色均匀，“龙眼”部分突出，对称，颇有庄严之感。
龙在佛教中具有特殊的意义，是守护佛法的护法之一，具有呼风唤雨的能力。（在佛语中：“龙象”一词可用来碧玉佛教中菩萨的发力无边的威仪，“龙应”指的是观音菩萨三应之一。）所以龙眼菩提子也代表着威严的法相，蕴含了镇邪增慧、邪不胜正的大修为。
龙眼菩提，尤其是产自印度的“山地”龙眼菩提子，被佛教人为是几位罕见的圣物，是佛法修行中修练者所必需的。我们若以文玩的心态对待，则不应刻意追求尺寸和新老，以平常心待之即可。
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